data;
/*
FULL-SIB.htm a data set with 1000 observations from swine, there are 4 pigs per mother,
with the variates DYR (animal) FAR (father) MOR (mother) SEX AAR (year) DTV (dayly gain)
FF (fodder comsumtion) KODPCT (meat per centage).
Calculate the genetic parametrs. ? */
INPUT DYR FAR MOR SEX AAR DTV FF KODPCT;
cards;
1001 1 11 0 1 734 3.23 71.10
1002 1 11 1 1 733 3.23 73.00
1003 1 11 0 1 706 2.95 65.70
1004 1 11 1 1 714 2.95 72.00
1005 1 13 0 1 814 2.73 63.30
1006 1 13 1 1 979 2.33 73.40
1007 1 13 0 1 775 3.21 67.00
1008 1 13 1 1 849 2.81 67.30
1009 1 15 0 1 865 2.73 66.90
1010 1 15 1 1 1038 2.23 69.30
1011 1 15 0 1 681 2.67 69.10
1012 1 15 1 1 772 2.47 64.70
1013 1 17 0 1 773 2.92 66.50
1014 1 17 1 1 904 2.72 67.20
1015 1 17 0 1 901 2.66 61.30
1016 1 17 1 1 930 2.66 68.90
1017 1 19 0 1 745 2.65 65.70
1018 1 19 1 1 749 2.65 68.80
1019 1 19 0 1 831 2.63 68.50
1020 1 19 1 1 952 2.43 69.10
1021 3 21 0 1 894 3.16 64.40
1022 3 21 1 1 1012 2.76 68.70
1023 3 21 0 1 770 2.90 63.40
1024 3 21 1 1 951 2.90 65.00
1025 3 23 0 1 861 2.95 66.10
1026 3 23 1 1 878 2.95 66.30
1027 3 23 0 1 777 3.02 68.70
1028 3 23 1 1 823 3.02 65.90
1029 3 25 0 1 836 2.83 63.70
1030 3 25 1 1 1139 2.23 67.20
1031 3 25 0 1 754 2.71 63.40
1032 3 25 1 1 934 2.71 63.20
1033 3 27 0 1 752 2.64 67.30
1034 3 27 1 1 870 2.64 67.30
1035 3 27 0 1 918 2.86 66.60
1036 3 27 1 1 1020 2.36 66.80
1037 3 29 0 1 885 2.89 61.10
1038 3 29 1 1 949 2.89 62.30
1039 3 29 0 1 862 2.40 63.50
1040 3 29 1 1 849 2.40 59.70
1041 5 31 0 1 869 2.56 64.00
1042 5 31 1 1 905 2.56 70.70
1043 5 31 0 1 947 2.69 68.90
1044 5 31 1 1 919 2.69 66.90
1045 5 33 0 1 832 2.62 64.40
1046 5 33 1 1 831 2.62 63.20
1047 5 33 0 1 839 2.61 69.20
1048 5 33 1 1 915 2.61 65.40
1049 5 35 0 1 860 2.64 64.90
1050 5 35 1 1 1090 2.24 68.40
1051 5 35 0 1 932 2.65 59.70
1052 5 35 1 1 861 2.65 66.00
1053 5 37 0 1 872 2.46 64.20
1054 5 37 1 1 944 2.46 67.90
1055 5 37 0 1 871 2.37 63.70
1056 5 37 1 1 895 2.37 72.00
1057 5 39 0 1 849 2.50 61.30
1058 5 39 1 1 1066 2.50 67.70
1059 5 39 0 1 715 2.93 67.40
1060 5 39 1 1 847 2.93 69.20
1061 7 41 0 1 867 2.57 64.60
1062 7 41 1 1 917 2.57 62.60
1063 7 41 0 1 953 2.46 63.80
1064 7 41 1 1 932 2.46 68.00
1065 7 43 0 1 838 2.60 64.10
1066 7 43 1 1 833 2.60 67.80
1067 7 43 0 1 903 2.89 62.80
1068 7 43 1 1 898 2.89 68.60
1069 7 45 0 1 929 2.53 64.50
1070 7 45 1 1 994 2.53 69.20
1071 7 45 0 1 932 2.80 68.20
1072 7 45 1 1 914 2.80 65.20
1073 7 47 0 1 904 2.87 63.20
1074 7 47 1 1 999 2.87 61.90
1075 7 47 0 1 801 2.40 61.90
1076 7 47 1 1 827 2.40 67.70
1077 7 49 0 1 795 2.38 61.80
1078 7 49 1 1 1001 2.38 68.70
1079 7 49 0 1 904 2.35 63.00
1080 7 49 1 1 762 2.35 71.10
1081 9 51 0 1 914 2.78 58.60
1082 9 51 1 1 1090 2.78 62.90
1083 9 51 0 1 796 2.78 59.60
1084 9 51 1 1 975 2.78 66.50
1085 9 53 0 1 918 2.69 65.10
1086 9 53 1 1 1020 2.69 69.10
1087 9 53 0 1 882 2.63 66.90
1088 9 53 1 1 1058 2.63 68.20
1089 9 55 0 1 970 2.88 62.20
1090 9 55 1 1 1005 2.88 62.60
1091 9 55 0 1 870 2.63 60.40
1092 9 55 1 1 956 2.63 68.40
1093 9 57 0 1 961 2.89 61.20
1094 9 57 1 1 1083 2.89 62.00
1095 9 57 0 1 848 2.58 64.00
1096 9 57 1 1 822 2.98 61.10
1097 9 59 0 1 971 2.46 66.00
1098 9 59 1 1 935 2.46 63.60
1099 9 59 0 1 888 2.93 63.50
1100 9 59 1 1 1037 2.93 67.50
2001 101 111 0 2 770 2.39 64.20
2002 101 111 1 2 958 2.39 64.00
2003 101 111 0 2 917 2.58 65.00
2004 101 111 1 2 863 2.58 64.80
2005 101 113 0 2 774 2.88 67.10
2006 101 113 1 2 877 2.88 66.20
2007 101 113 0 2 864 2.69 61.90
2008 101 113 1 2 859 2.69 64.30
2009 101 115 0 2 816 2.60 58.90
2010 101 115 1 2 1068 2.20 67.20
2011 101 115 0 2 855 2.31 59.50
2012 101 115 1 2 974 2.31 64.30
2013 101 117 0 2 906 2.68 65.40
2014 101 117 1 2 864 2.68 68.00
2015 101 117 0 2 814 2.65 61.30
2016 101 117 1 2 862 2.65 67.30
2017 101 119 0 2 910 2.29 60.90
2018 101 119 1 2 1067 2.29 66.70
2019 101 119 0 2 805 2.66 64.80
2020 101 119 1 2 863 2.66 70.50
2021 103 121 0 2 909 2.66 64.40
2022 103 121 1 2 921 2.66 66.00
2023 103 121 0 2 811 2.88 62.30
2024 103 121 1 2 862 2.88 62.00
2025 103 123 0 2 918 3.01 64.50
2026 103 123 1 2 921 3.01 67.70
2027 103 123 0 2 768 2.75 62.80
2028 103 123 1 2 1016 2.75 66.10
2029 103 125 0 2 832 2.57 61.60
2030 103 125 1 2 894 2.57 68.60
2031 103 125 0 2 807 2.85 61.10
2032 103 125 1 2 948 2.85 63.50
2033 103 127 0 2 1060 2.21 62.00
2034 103 127 1 2 942 2.21 67.70
2035 103 127 0 2 887 2.47 64.90
2036 103 127 1 2 862 2.47 65.30
2037 103 129 0 2 929 3.06 64.40
2038 103 129 1 2 896 3.06 69.00
2039 103 129 0 2 893 2.68 62.40
2040 103 129 1 2 875 2.68 66.80
2041 105 131 0 2 756 2.69 65.20
2042 105 131 1 2 945 2.69 64.70
2043 105 131 0 2 1239 2.20 68.00
2044 105 131 1 2 939 2.40 62.20
2045 105 133 0 2 892 2.76 65.00
2046 105 133 1 2 808 2.76 65.50
2047 105 133 0 2 821 2.98 61.80
2048 105 133 1 2 863 2.98 62.80
2049 105 135 0 2 780 2.47 65.90
2050 105 135 1 2 936 2.47 62.80
2051 105 135 0 2 890 2.56 65.60
2052 105 135 1 2 900 2.56 63.40
2053 105 137 0 2 855 2.48 59.10
2054 105 137 1 2 938 2.48 66.10
2055 105 137 0 2 754 2.79 64.20
2056 105 137 1 2 833 2.79 62.90
2057 105 139 0 2 721 2.78 58.10
2058 105 139 1 2 866 2.78 69.80
2059 105 139 0 2 844 2.79 64.90
2060 105 139 1 2 1195 2.19 68.60
2061 107 141 0 2 851 2.29 71.30
2062 107 141 1 2 847 2.29 66.50
2063 107 141 0 2 888 2.46 65.50
2064 107 141 1 2 1028 2.46 68.00
2065 107 143 0 2 742 2.94 67.30
2066 107 143 1 2 948 2.94 64.90
2067 107 143 0 2 850 2.53 64.60
2068 107 143 1 2 820 2.53 70.80
2069 107 145 0 2 845 2.39 71.00
2070 107 145 1 2 928 2.39 72.50
2071 107 145 0 2 779 2.72 60.20
2072 107 145 1 2 894 2.72 68.40
2073 107 147 0 2 1001 3.08 65.20
2074 107 147 1 2 767 3.08 68.00
2075 107 147 0 2 888 2.72 64.30
2076 107 147 1 2 884 2.72 67.10
2077 107 149 0 2 845 2.81 66.70
2078 107 149 1 2 908 2.81 66.60
2079 107 149 0 2 859 2.71 61.70
2080 107 149 1 2 907 2.71 63.50
2081 109 151 0 2 896 2.81 70.20
2082 109 151 1 2 876 2.81 72.00
2083 109 151 0 2 899 2.87 64.90
2084 109 151 1 2 954 2.87 72.70
2085 109 153 0 2 1056 2.47 67.70
2086 109 153 1 2 862 2.47 68.00
2087 109 153 0 2 837 3.11 70.20
2088 109 153 1 2 796 3.11 65.30
2089 109 155 0 2 767 2.74 62.70
2090 109 155 1 2 944 2.74 66.50
2091 109 155 0 2 888 2.72 63.10
2092 109 155 1 2 1052 2.12 72.00
2093 109 157 0 2 776 2.51 67.90
2094 109 157 1 2 935 2.51 72.30
2095 109 157 0 2 831 2.87 60.50
2096 109 157 1 2 920 2.87 64.00
2097 109 159 0 2 734 2.72 67.80
2098 109 159 1 2 926 2.72 64.90
2099 109 159 0 2 895 2.72 64.70
2100 109 159 1 2 1011 2.72 67.40
3001 201 211 0 3 983 2.46 67.30
3002 201 211 1 3 963 2.46 68.40
3003 201 211 0 3 847 2.52 61.90
3004 201 211 1 3 846 2.52 72.20
3005 201 213 0 3 823 2.55 64.30
3006 201 213 1 3 943 2.55 68.10
3007 201 213 0 3 732 2.65 63.90
3008 201 213 1 3 912 2.65 66.40
3009 201 215 0 3 938 2.53 62.50
3010 201 215 1 3 982 2.53 65.90
3011 201 215 0 3 968 2.53 65.70
3012 201 215 1 3 1056 2.53 62.70
3013 201 217 0 3 830 3.27 61.70
3014 201 217 1 3 745 3.27 68.00
3015 201 217 0 3 804 2.56 64.90
3016 201 217 1 3 878 2.56 68.30
3017 201 219 0 3 890 2.82 61.80
3018 201 219 1 3 916 2.82 63.90
3019 201 219 0 3 771 2.69 65.70
3020 201 219 1 3 1015 2.69 65.90
3021 203 221 0 3 838 2.31 68.50
3022 203 221 1 3 1058 2.31 67.20
3023 203 221 0 3 882 2.51 67.80
3024 203 221 1 3 965 2.51 69.70
3025 203 223 0 3 839 2.75 65.80
3026 203 223 1 3 828 2.75 71.20
3027 203 223 0 3 893 2.45 64.20
3028 203 223 1 3 927 2.45 67.70
3029 203 225 0 3 891 2.50 62.90
3030 203 225 1 3 853 2.50 68.00
3031 203 225 0 3 765 2.42 58.60
3032 203 225 1 3 1059 2.42 60.70
3033 203 227 0 3 982 2.87 62.80
3034 203 227 1 3 893 2.87 60.80
3035 203 227 0 3 839 2.61 64.20
3036 203 227 1 3 943 2.61 66.50
3037 203 229 0 3 883 2.58 60.50
3038 203 229 1 3 933 2.58 65.40
3039 203 229 0 3 958 2.71 67.20
3040 203 229 1 3 926 2.71 69.00
3041 205 231 0 3 1121 2.25 70.50
3042 205 231 1 3 786 2.65 68.20
3043 205 231 0 3 800 2.57 68.90
3044 205 231 1 3 927 2.57 68.80
3045 205 233 0 3 676 2.98 65.40
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10055 905 937 0 5 846 2.19 63.30
10056 905 937 1 5 939 2.19 72.40
10057 905 939 0 5 822 2.34 67.30
10058 905 939 1 5 1037 2.34 70.20
10059 905 939 0 5 913 2.55 65.90
10060 905 939 1 5 922 2.55 67.60
10061 907 941 0 5 846 2.52 65.50
10062 907 941 1 5 853 2.52 67.20
10063 907 941 0 5 857 2.17 69.10
10064 907 941 1 5 866 2.17 63.20
10065 907 943 0 5 670 2.83 61.10
10066 907 943 1 5 945 2.83 64.70
10067 907 943 0 5 850 2.71 65.90
10068 907 943 1 5 708 2.71 63.10
10069 907 945 0 5 872 2.37 66.70
10070 907 945 1 5 800 2.37 69.80
10071 907 945 0 5 865 2.48 67.40
10072 907 945 1 5 821 2.48 70.00
10073 907 947 0 5 855 2.95 66.80
10074 907 947 1 5 1042 2.95 67.00
10075 907 947 0 5 892 2.44 65.00
10076 907 947 1 5 888 2.44 63.90
10077 907 949 0 5 947 2.46 62.80
10078 907 949 1 5 1103 2.46 66.80
10079 907 949 0 5 840 2.37 64.00
10080 907 949 1 5 967 2.37 69.40
10081 909 951 0 5 963 2.75 65.60
10082 909 951 1 5 960 2.75 63.50
10083 909 951 0 5 795 2.68 65.70
10084 909 951 1 5 841 2.68 62.80
10085 909 953 0 5 830 2.42 69.80
10086 909 953 1 5 947 2.42 64.70
10087 909 953 0 5 768 2.69 62.40
10088 909 953 1 5 975 2.69 66.70
10089 909 955 0 5 932 2.53 65.80
10090 909 955 1 5 940 2.53 67.40
10091 909 955 0 5 849 2.53 64.90
10092 909 955 1 5 913 2.53 62.20
10093 909 957 0 5 989 2.45 64.30
10094 909 957 1 5 987 2.45 66.40
10095 909 957 0 5 901 2.63 65.50
10096 909 957 1 5 884 2.63 66.80
10097 909 959 0 5 932 2.70 66.10
10098 909 959 1 5 997 2.70 71.30
10099 909 959 0 5 875 2.53 67.70
10100 909 959 1 5 697 2.99 61.30
PROC SORT; BY AAR FAR MOR sex;
PROC nested;
CLASS AAR FAR MOR sex;
VAR DTV FF KODPCT; run;
/* alternativ analyse kan køres via GLM og varcomp proceduren */
proc glm ;
class FAR MOR AAR sex;
model DTV FF KODPCT = AAR FAR MOR sex ;
manova h= far mor aar sex;
random far mor;
* means sex aar far mor;
run;
proc varcomp maxiter=50 method=reml;
class FAR MOR AAR sex;
model DTV FF KODPCT = AAR FAR MOR sex ;
run;