Términos genéticos de genes y alelos.
La raza Labrador Retriever tiene los colores amarillo y negro. Así
considerando un gen de color amarillo, que apunta a un locus y un alelo.
Esto corresponde a los principios de la comprensión de
los genes que hay una variante (amarillo), correspondiente a la de tipo salvaje (negro).
El término "gen" no debe ser utilizado cuando se habla de un polimorfismo de ADN secuencias codificantes
con más alelos. En cambio, el término "lugar", locus debe ser utilizado.
Esta terminología
también debe ser utilizada en relación con
variantes genéticas. No siempre existe una fuerte separación entre el gen y el locus,
y entre el gen y el alelo en la práctica.
Así que cuando las frecuencias génicas se mencionan en este capítulo, se
incluyen los genes en el sentido tradicional y los alelos
no codificante secuencias de un ADN (locus).
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Figura 2.1.
Albúmina tipo es heredado co-dominante, lo que significa que ambos
alelos se pueden ver directamente en el gel. Los fenotipos,
visto en el gel, son un SS, un SF y un FF tipo. Después de la electroforesis las muestras de suero albúmina
en el gel se tiñe con Amidoblack.
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Método de conteo de genes, la herencia co-dominante, Fenotipo = Genotipo
Los datos de un estudio de los tipos de la albúmina en la raza de perro Pastor Alemán danés se utilizan
para explicar los principios, véase la Tabla
1, sección 2.4. Cuando el suero se prueba en un gel electroforesis los alelos
son un "rápido" y un "lento" de albúmina designado como el alelo F y S,
respectivamente. Véase la Figura 2.1. Las investigaciones
se han llevado a cabo por el K. Christensen et al. 1985,
Hereditas, 102:219-223.
Los siguientes números de los tres genotipos de albúmina fueron encontrados en una población.
--------- Genotipo SS SF FF Total Número 36 47 23 106 Frecuencia 0,34 0,44 0,22 = 1,00 ----------
La frecuencia de SS tipo se calcula como 36/106 = 0,34
Las frecuencias génicas para S se basan en el método de gen conteo, todos los individuos SS tienen 2 S alelos y los individuos SF tienen 1. Esto es relativo a todos los genes en la población, que son 2*106.
La frecuencia de la S tipo se calcula como p = (2*36 + 47)/(2*106) = 0,56
" F " q = (2*23 + 47)/(2*106) = 0,44
------
1,00
A la frecuencia del primer alelo se da normalmente el símbolo p, y al segundo alelo el símbolo q. Si hay más alelos son continuación de los símbolos en orden alfabético.
Una frecuencia de alelo corresponde a una probabilidad y, por tanto, la suma de alelos (frecuencias génicas) es 1. Para ver formulaciones estadística básica aquí, o ver Samuels, Estadísticas para Ciencias de la Vida, en inglés
Ejemplos de alelos múltiples (más de dos alelos)
En la sección 1.5 la segregación de una mikrosatellite en una familia porcina fue
mencionada. Existen tres alelos como puede verse en el gel en la Figura 2.2.
Las denominaciones de alelos son 209, 199 y 195.
Figura 2.2 Separación de la variación genética (mikrosatellite) en una familia porcina, detectados por gel electroforesis. El cerdo Cup lleva los alelos 209 y 195 y la hembra 400 lleva los alelos 199 y 195. La mayoría de los animales son heterocigotos cada uno con dos bandas. Las homocigotes sólo tienen una banda. El gel estuve preparado por Prof. Merete Fredholm |
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Los cálculos de las frecuencias génicas por medio de los métodos de conteo de genes se muestran a continuación. Para el alelo hay 18 heterocigotos y 2 homocigotos (sin bandas en la línea bajo). Recuenta por ti mismo Para el alelo'199' hay 12 heterocigotos y 0 homocigoto (todos tienen 12 bandas en '199') y una línea de banda, ya sea en otros '195 ' o '209'). Reconté de nuevo
Frecuencia de'209'calculado como p = (2*2 + 18)/(2*44) = 0,250 " '199' " q = (2*0 + 12)/(2*44) = 0,134 " '195' " r = 1 - p - q = 0,616
La última frecuencia de los alelos es más fácilmente calculada como
la diferencia, ya que la suma de las frecuencias de los alelos es 1.
Figura 2.3. El Labrador Retriever con el color normal
de negro y con la segregación del recesivo
color amarillo debido a los alelos en el locus de extensión.
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Método de la raíz cuadrada, para
herencia dominante
En una población de Labrador Retrievers los siguientes números de los dos fenotipos se encontraron:
--------- Fenotipo Negro Amarillo Total Genotipo EE+Ee ee Número 182 18 200 Frecuencia 0,91 0,09 = 1,00 ----------
El tipo de color negro representa homocigotos y heterocigotos. Si dos perros negros son acoplados aleatoriamente, en ocasiones se obtiene crías de color amarillo. Esto ocurre cuando los dos perros por aleatorias son del color genotipo Ee.
El método de gen conteo implica que el fenotipo es igual al genotipo, pero esto sólo es el caso de amarillo. Para una descendencia para ser amarillo, debe tener un gen tanto de su padre y madre, cada uno con una probabilidad de q. Por lo tanto, la probabilidad de regla de multiplicación se puede aplicar para calcular la frecuencia de genotipo ee lo que corresponde a q2. Los materiales de datos da que la frecuencia se estima como 18/200 = 0,09.
La raíz cuadrada de 0,09 es q = 0,30.
La frecuencia de los genes negro en la población se obtiene p = 1 - q = 0,7.