4.4 Manipulación de un matriz general y el cálculo de la relación y la consanguinidad

La relación y la consanguinidad, y la parte de la inversión del método de la matriz han sido programadas por Nils Toft y Thomas Nejsum Madsen, respectivamente, mientras la parte matriz general se ha producido de Bryan Lewis. La parte general incluyen, por ejemplo matrix multplication como A = b*c o A = b*c'. Enlace otras aplicaciones de la General Matrix Applet: Estimación valores de cría del modelo animales y calcular índice de selección.

... Input aera ....                    ....Output area ....
Set digit for print ->

Editando los datos en el campo de datos es muy molesto, como la tecla de retorno no puede ser utilizada para hecha una nueva línea, ya que funciona como pulsar el eval. botón. Para grandes conjuntos de datos útilice 'Bloc de notas' o cualquier otro editor. Mover los datos al área de entrada por medio de la corta y pega usando Ctrl-ins (copia) y el cambio-ins (insertar).


Ejemplo:
Ejemplo de cálculo de la consanguinidad en las columnas de la matriz que se muestra a continuación son los animales, padre y madre, donde los animales más viejos deben aparecer primero. La genealogía se convertido en la matriz 'a' como se hace a continuación (0 significa padre desconocido):
Animal Padre Madre
---------------
 a =
 1     0   0
 2     1   0
 3     1   0
 4     1   0
 5     2   3
 6     4   3
 7     5   6

Copia estos datos, incluyendo (a =) y pegan los en el "input area" y después pulsar el "evaluate" botón y la matriz debe aparecer en la ventana del resultado.
Después entrar en la ventana de entrada:

      rel = :tabular(a)
y pulsar el 'evaluate' botón

La matriz de relación (rel) aparecerá en la ventana de resultados y se muestran a continuación. Número de dígitos se pueden establecer, en sustitución de los 4 con 3 cambiará el número de dígitos a 3.

        Relationship matrix  1+F (inbreeding) in the diagonal 
         rel =
             1.000    0,500   0,500   0,500   0,500   0,500   0,500
             0,500    1.000   0,250   0,250   0,625   0,250   0,437
             0,500    0,250   1.000   0,250   0,625   0,625   0,625
             0,500    0,250   0,250   1.000   0,250   0,625   0,437
             0,500    0,625   0,625   0,250   1.125   0,437   0,781
             0,500    0,250   0,625   0,625   0,437   1.125   0,781
             0,500    0,437   0,625   0,437   0,781   0,781   1.218

La consanguinidad de cada animal está dada por su elemento en la diagonal, menos uno, es decir, los últimos tres animales tienen un coeficiente de consanguinidad de 0,125, 0,125 y 0,218, respectivamente.
Los números de identificación de cada uno de los animales puede ser cualquier número, siempre y cuando los animales más viejos aparecen primero en la lista. Al definir la base (más antigua) generación de los padres se establecen como ceros (0 = desconocido).

Si usted está interesado en el coeficiente de consanguinidad, sólo, se ejecuta el comando 'inbred' de la siguiente manera:

      inb = :inbred(a)
usted tendrá la siguiente, en la ventana de resultados, con el número de animales y coeficiente de consanguinidad:
	Animal   F (inbreeding) 
      inb =
 	1.000	 0,000	
 	2.000	 0,000	
 	3.000	 0,000	
 	4.000	 0,000	
 	5.000	 0,125	
 	6.000	 0,125	
 	7.000	 0,218	

Para invertir la matriz de relación se utilizan el comando:

        reli = :invert(rel)
Que pone la matriz de relación inversa en la ventana de resultados

Cuestiones: En el árbol genealógico que se muestra a continuación los individuos se han asignado los números 1-11.
Animal Padre Madre,  0=desconocido
    1     0   0
    2     0   0
    3     0   0
    4     0   0
    5     0   0
    6     2   1
    7     5   4
    8     7   3
    9     7   6
   10     7   8
   11     10  9
Calcula el coeficiente de consanguinidad de los individuos número 10 y 11, y calcular el coeficiente de relación entre 11 y todos los demás en el árbol genealógico. El conjunto de datos que se utilizará para los cálculos se da arriba, (recuerda el a= antes los datos).

¿Cuál sería el coeficiente de consanguinidad después del 5 generación de apareamiento de hermanos completo?


Volver a la teoría o Volver al otro applets.